A AERJ foi fundada em 2002, a partir de mobilizações de grêmios estudantise e movimentos de juventude que buscavam construir uma representação estudantil estadual democrática e combativa no Rio de Janeiro.

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Desde o início, o objetivo da associação é defender os direitos dos estudantes, fortalecer a educação pública, gratuita e de qualidade, e ampliar o protagonismo da juventude nos espaços de decisão e transformação social.

Inspirada na tradição das lutas secundaristas brasileiras, a AERJ nasceu com o compromisso de organizar os estudantes do ensino médio e fundamental, articulando-se com escolas de diferentes regiões do estado e promovendo ações de formação política, cultural e cidadã.

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Ao longo dos anos, participou ativamente de mobilizações por melhorias nas escolas, pelo passe livre estudantil, contra cortes na educação e em defesa da democracia. 

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Nos últimos anos, a AERJ expandiu sua atuação com projetos como SAMBAERJ e o Curso Popular da AERJ, iniciativa que oferece formações gratuitas e acessíveis para jovens e trabalhadores, reafirmando seu compromisso com a educação popular e inclusiva.

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Hoje, a AERJ é reconhecida como uma das principais entidades de representação estudantil do Brasil, mantendo viva a luta por uma educação pública transformadora e por uma juventude que constrói o futuro de forma coletiva.